云南省医疗保险基金管理中心

承担省本级城镇职工、离退休干部、省属在昆高校大学生的医疗保险、生育保险、长期护理保险、医疗救助等经办服务工作。

云南省医疗保险异地费用结算中心

承担全省医疗保险异地费用结算经办服务工作。

云南省医疗保障基金运行监测评估中心

负责医疗保障数据信息系统的建设、运行、维护工作；负责医疗保障基金运行监测、分析评估工作；负责依法对定点医药机构及其他组织涉及医疗保障基金的有关情况进行网络监测。